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摘要
目的 了解新疆维吾尔自治区(简称新疆)部分地区牛、羊细粒棘球蚴感染情况和基因多态性，为该地区细粒棘球蚴病的防治提供数据参考。方法于2020—2021年从伊宁市、阿勒泰市、塔城市、昭苏县、特克斯县、额敏县、博乐市的定点屠宰场采集屠宰后牛、羊的肝脏和肺脏，通过肉眼观察与触摸初步判定感染情况，采集疑似细粒棘球蚴包囊并提取DNA, PCR扩增细粒棘球绦虫细胞色素氧化酶1 (cox1)基因并测序。从GenBank中下载细粒棘球绦虫cox1基因G1、 G3、 G4、 G5、 G6型序列，与测定的序列行BLAST比对。利用MEGA 7.0软件用邻接法构建系统进化树，用Popart软件构建cox1基因单倍型网络图，用DnaSPv5软件分析cox1基因多态性位点。使用SPSS17.0软件进行统计学分析，对不同地区牛、羊及不同脏器感染率的比较采用χ2检验。结果新疆7个县(市)共调查4 977头(只)牛、羊(牛563头、羊4 414只)，采集到疑似细粒棘球蚴包囊141份，其中121份扩增出850 bp的条带并测序成功。牛、羊总感染率为2.07%(103/4 977)，其中博乐市牛、羊的感染率最高(6.50%, 32/492)，与伊宁市(1.80%, 38/2 108)、塔城市(1.14%, 9/790)、特克斯县(1.06%, 2/189)、额敏县(0.72%, 7/970)相比，感染率差异有统计学意义(χ2=49.873、 33.682、 8.762、28.666，均P <0.05)。牛、羊的感染率分别为3.02%(17/563)、 1.95%(86/4 414)，两者差异有统计学意义(χ2=14.296, P <0.05)。共采集羊肝、肺包囊101份，其中肝包囊占42.57%(43/101)，肺包囊占27.72%(28/101)，肝、肺合并感染包囊占29.70%(30/101)。共采集牛肝、肺包囊20份，其中肝包囊占25.00%(5/20)，肺包囊占45.00%(9/20)，肝、肺合并感染包囊占30.00%(6/20)。BLAST比对结果显示，121条序列中120条(99.2%)与细粒棘球绦虫G1基因型序列(MN886258.1、 MG280957.1、 KX020359.1和MG672143.1)的同源性为98%～100%，在系统进化树上聚为一支；1条(0.8%)与G3基因型序列(MG682532.1)的同源性为100%，在系统进化树上聚为一支。单倍型分析结果显示，cox1基因序列共有18个单倍型，Hap 1～Hap 17为G1型，Hap 18为G3型，其中Hap 1为最大的单倍型群体；18个单倍型间共有20个变异位点。序列比对结果显示，121条序列中有52条出现了碱基的转换和颠换。结论 新疆7个县(市)牛、羊细粒棘球蚴感染率存在明显差异，感染细粒棘球蚴的基因型为G1 (99.2%)、 G3 (0.8%)，有18个单倍型，Hap 1为主要致病单倍型。
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