阴道毛滴虫Rab11鸟苷三磷酸酶cDNA克隆和序列分析

作者:张仁利; 许铭炎; 许锦阶; 高世同; 黄达娜; 耿艺介; 傅玉才
来源:热带医学杂志, 2006, 6(3): 267-270,283.
DOI:10.3969/j.issn.1672-3619.2006.03.011

摘要

目的近年研究表明Rab11鸟苷三磷酸酶在调节各种真核细胞的膜转运通道中发挥着重要作用.但是,对于原生动物毛滴虫膜转运系统的研究仍甚少.本研究旨在克隆和分析阴道毛滴虫Rab11鸟苷三磷酸酶基因,以便进一步探讨其功能.方法使用SMART cDNA文库构建试剂盒构建阴道毛滴虫cDNA表达文库,用生物信息学进行TvRab11同源分析,鉴定TvRab11基因,用PCR方法扩增基因组DNA,TA克隆TvRab11 cDNA、测序及序列分析.结果在分离出的cDNA克隆中发现一个Rab11鸟苷三磷酸酶同源基因.该cDNA序列长710 bp,读码框含636 bp,推测蛋白质序列具211个氨基酸.序列分析表明该基因系Rab11亚家族的同源基因,其推测肽链与拟南芥Rab11c的同源性最高(一致性60%,相似性79%),与人类Rab11b次之(一致性58%,相似性78%).该氨基酸序列拥有Rab鸟苷三磷酸酶家族的所有保守结构域和特异性Rab结构域(RabF1-5).进化树分析也表明该基因系Rab11的同源基因.序列分析还显示该基因的基因组DNA序列与cDNA序列完全一致,提示该基因无内含子.结论分析表明该基因是阴道毛滴虫Rab11鸟苷三磷酸酶同源基因,其功能有待进一步研究.

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