2个品种山羊瘤胃菌群结构比较及其功能预测分析

作者：张瑜; 张叁保; 申玉建; 胡艳; 高小童; 韦英明; 蒋钦杨

来源：南方农业学报, 2021, 1-11.

• 都安山羊
• 努比亚山羊
• 16S rDNA
• 瘤胃微生物
• 功能

【目的】研究2个不同品种的山羊瘤胃菌群结构及其功能间的差异。【方法】随机挑选都安山羊和努比亚山羊健康母羊各3只，采用16S rDNA扩增子高通量测序的方法研究都安山羊和努比亚山羊瘤胃微生物区系特征和品种间的差异。【结果】2个品种间瘤胃微生物在门水平上组成相似，其中厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和变形菌门（Proteobacteria）是优势菌门，都安山羊样品中平均相对丰度分别为58.32%、29.41%和4.26%；努比亚山羊样品中平均相对丰度分别为45.66%、38.69%和6.59%。在属水平上，Quinella、普氏菌属＿1（Prevotella＿1）和理研菌科RC9肠道群（Rikenellaceae＿RC9＿gut＿group）是优势菌属，都安山羊样品中平均相对丰度分别为36.93%、9.67%和12.07%；努比亚山羊样品中平均相对丰度分别为12.91%、13.92%和11.47%。品种间差异物种分析结果表明，门水平上，都安山羊uncultured＿bacterium＿k＿bacteria（P＜0.01）和Lentisphaerae（P＜0.05）的相对丰度显著低于努比亚山羊。属水平上，都安山羊Quinella的相对丰度显著高于努比亚山羊（P＜0.01）；都安山羊Pyramidobacter、Ruminococcaceae＿UCG-010、probable＿genus＿10、Ruminococcaceae＿UCG-002、Flexilinea、Desulfovibrio、Butyrivibrio、Mogibacterium等13个属的相对丰度显著低于努比亚山羊（P＜0.05）。瘤胃微生物PICRUSt2软件预测功能比较发现，都安、努比亚山羊瘤胃微生物功能在脂质代谢、碳水化合物代谢、其它氨基酸代谢和神经系统相关等功能存在差异。【结论】品种对山羊瘤胃微生物区系的组成具有一定影响，且瘤胃微生物在属水平上差异明显。

• 单位
  广西大学