云南水牛mtDNA D-loop遗传多样性研究

作者：亐开兴; 金显栋; 张继才; 尹以昌; 李红伟; 和嘉荣; 和占星; 罗再仁; 雷初朝; 黄必志^*

来源：中国牛业科学, 2020, 46(06): 1-4.

• 云南水牛
• mtDNA D-loop
• 遗传多样性

[目的]探究云南3个水牛品种(德宏水牛、滇东南水牛、盐津水牛)的mtDNA D-loop区的遗传多样性与母系起源。[方法]采用PCR扩增、测序及生物信息学方法。[结果]本研究共分析了215条云南水牛mtDNA D-loop全序列,检测到107个多态位点,定义了86种单倍型。结果表明,云南3个水牛品种的mtDNA遗传多样性非常丰富,其中,滇东南水牛的遗传多样性最高(Hd:0.946±0.017,Pi:0.0162±0.0018),盐津水牛的遗传多样性最低(Hd:0.805±0.063,Pi:0.0141±0.0031)。系统发育分析结果表明,在3个云南水牛品种中检测到2个主要支系(A和B支系及其亚支系)及1个稀有支系C,其中A支系为主要支系(79.07%),且经历了强烈的群体扩张。[结论]云南3个水牛品种具有丰富的mtDNA遗传多样性,主要有A与B 2个母系起源。

• 单位
  动物科技学院; 西北农林科技大学; 云南省草地动物科学研究院