基因芯片技术筛选结直肠癌腹膜转移相关基因

作者：刘峰; 郭久冰; 沈智勇; 牟廷玉; 智鹏柯; 李国新

来源：南方医科大学学报, 2012, 32(03): 400-403.

• 结直肠癌
• 腹膜转移
• 基因芯片 colorectal cancer
• peritoneal metastasis
• genome-wide microarray

目的筛选和鉴定结直肠癌腹膜种植转移相关基因。方法收集手术切除3例伴有腹膜种植转移的结直肠腺癌病人原发病灶和正常黏膜的新鲜组织标本,提取总RNA,经逆转录合成cDNA后经体外扩增合成aRNA,Cy3荧光分子标记后和人类全基因组表达谱芯片杂交,采用经验贝叶斯方法(P≤0.05)筛选出差异表达基因,并用RT-PCR实验对部分差异表达基因进行验证。结果满足(P≤0.05)的基因共有105个。其中和正常组织相比,在肿瘤组织表达上调的基因有42个,表达下调的基因有63个。通过生物信息学分析,在表达上调基因中选择3条(S100P;PRDX1;SLPI)基因进RT-PCR行验证,结果与芯片结果完全相符。结论基...

• 单位
  南方医科大学南方医院