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摘要
目的 通过基因差异表达谱及加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法构建并分析骨质疏松症相关的miRNA-mRNA调控网络，全面阐释骨质疏松症的发病机制。方法 首先在GEO数据库中获取微阵列数据集，进行差异分析及WGCNA分析，获取差异miRNA和临床相关性最高的模块基因，并取交集。预测潜在上游转录因子及下游靶基因。同时，获取差异表达mRNA并与预测靶基因取交集得到关键miRNA目标靶基因，进行目标靶基因GO和KEGG通路富集分析。通过String获取目标靶基因PPI关系文件，然后通过Cytoscape构建并分析miRNA-mRNA网络。结果 共得到6个与骨质疏松症疾病相关的关键miRNA,其中2个差异性上调、4个差异性下调，其主要转录因子为SP4、LHX3、NFIC、MYC和VSX2。通过将预测得到的关键miRNA靶基因和差异表达mRNA取交集，获得目标靶基因52个。GO和KEGG富集分析显示目标靶基因涉及多个生物学进程及通路，其中趋化因子信号通路、P53信号通路值得关注。结论 骨质疏松症miRNA-mRNA表达是通过多途径、多靶点进行调控的，hsa-mir-4500、CDKN1A、MAP2K7组成其核心调控网络。本研究为深入探讨骨质疏松症的分子机制提供了新的思路，发现了新的潜在靶点，对阐明其发病机制及防治药物的开发具有重要的指导意义。
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单位广州中医药大学第三附属医院; 广州中医药大学
