制度因素是影响区域经济发展的最重要的因素;恰当的制度是经济增长的必要条件。影响区域经济发展进程的主要制度有区域资源配置的制度、中央与地方政府事权与财权制度、区域分工中企业产权制度改革与现代企业制度、区域的公共管理制度与区域基础设施供给制度等。而制度创新将是推动区域经济持续协调发展的重要途径。