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摘要
簇毛麦是小麦遗传改良的重要基因资源之一，其2V染色体上携有抗白粉病、护颖颖脊刚毛、光周期响应、长穗多粒等许多普通小麦所不具备的优良基因，但缺乏足够的分子标记，不能准确鉴定导入小麦的2V染色质。为了开发2V染色体上特异分子标记，本研究设计了2套引物，一套是基于普通小麦第2群染色体不同区段表达序列标签设计的序列标记位点引物30对，另一套是基于小麦2D、黑麦2R测序结果同源比对的差异设计的内含子定位引物296对，分别筛选出2个和33个2V染色体特异分子标记，占总引物数6.7%和11.1%，说明基于新一代高通量测序技术设计内含子定位引物是一种开发染色体特异性标记的高效方法。研究结果进一步发现，大多数位于小麦2D染色体上的基因可以分别对应2V染色体相同区段上的基因，但也有例外，说明簇毛麦2V染色体与普通小麦2D染色体之间存在复杂的共线性关系。本研究共开发出35个标记，并对其可靠性进行了验证，其中lfz8187-1100定位于2VS FL0.68-1.00,lfz8387-280、lfz8462-760和lfz8470-200定位于2VS FL0.00-0.26，其余31个标记定位于2VL。这些分子标记为鉴定2V染色体结构变异提供了有效工具，也为鉴定导入普通小麦的2V染色体携带的有益基因提供了技术支撑。
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