2017-2018年广东省深圳市疱疹性咽峡炎患者肠道病毒分子流行病学研究

作者：陈龙; 杨洪; 姚相杰; 孟君; 张海龙; 张仁利; 何雅青^*

来源：疾病监测, 2023, 38(09): 1048-1053.

• 疱疹性咽峡炎
• 柯萨奇A群病毒
• 病原检出率
• 基因分型

目的 了解广东省深圳市疱疹性咽峡炎（HA）病原组成与病原体的分子特征，为HA的预防与控制提供科学依据。方法 2017—2018年收集了157例HA患者的314份临床样本，其中粪便样本和咽拭子各157份。使用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）和基于半巢式RT-PCR扩增的测序方法对肠道病毒（EV）进行检测与分型。使用生物信息学软件对病毒VP1基因进行序列分析。结果 在126例（80.30%, 126/157）EV阳性的患者中，共检出10种EV，检出率最高的是柯萨奇病毒A组10型（CVA10）(19.70%, 31/157)，其次是CVA4(17.80%, 28/157)、CVA6(15.30%, 24/157)和CVA2 (10.80%, 17/157)，其他病原体包括CVA5(4.50%, 7/157)、CVA16(3.20%, 5/157)、EV-A71(1.30%, 2/157)、CVA8(0.60%, 1/157)、CVB5(0.60%,1/157)和埃可病毒11(E11)(0.60%, 1/157),1例为CVA4与CVA10的混合感染（0.60%, 1/157）。2017年检出率最高的两种病原体是CVA2和CVA6，而2018年却是CVA10和CVA4。粪便样本与咽拭子的病原检出率之间的差异没有统计学意义（χ2=0.019,P=0.892）。基于VP1序列的分子系统发育分析表明，本研究CVA10毒株均为C2基因型。CVA4除了1株为C5基因型外，其余均为C2基因型。1株CVA6毒株位于先前未描述的进化分支，其他CVA6毒株均为D3a基因亚型。CVA2毒株均为D2基因型。结论 粪便样本与咽拭子都适用于HA的病原体核酸检测。CVA10、CVA4、CVA6和CVA2是2017—2018年深圳市HA的优势病原体，大部分毒株是我国主流基因型，个别毒株处于不常见的基因型或进化分支。

• 单位
  深圳市疾病预防控制中心