松辽黑猪FOXA2基因第3外显子多态性及其与繁殖性状的关联分析

作者：张方玮; 张琪; 张云鹏; 李欣; 张净搏; 张树敏^*; 于永生^*

来源：中国畜牧兽医, 2023, 50(04): 1444-1451.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2023.04.016

• 松辽黑猪
• FOXA2基因
• 第3外显子
• 繁殖性状
• 关联分析
• 遗传标记

【目的】分析叉头框家族转录因子A2(forkhead box A2,FOXA2)基因第3外显子多态位点在地方猪种中的遗传多样性及其与松辽黑猪繁殖性状的相关性。【方法】采集90头健康经产松辽黑猪母猪耳组织，采用直接测序法检测FOXA2基因第3外显子SNP位点，利用SPSS 26.0软件分析FOXA2基因第3外显子SNP位点多态性(基因型频率、基因频率、遗传纯合度、遗传杂合度、有效等位基因数、多态信息含量)及其与松辽黑猪母猪繁殖性状(总产仔数、产活仔数、乳头数以及仔猪初生重、3周龄重、断奶重、断奶仔猪数)的相关性。【结果】松辽黑猪FOXA2基因第3外显子共检测出3个SNPs位点，1 337 bp处SNP位点(C1337A)上发现CC、CA和AA 3种基因型；1 343 bp处SNP位点(C1343G)上发现CC、CG和GG 3种基因型；1 626 bp处SNP位点(C1626T)上发现CC、CT和TT 3种基因型。卡方适合性检验表明，松辽黑猪FOXA2基因第3外显子的C1337A、C1626T位点符合哈迪-温伯格平衡状态(P>0.05),C1343G位点偏离哈迪-温伯格平衡状态(P<0.05)。多态信息含量(PIC)计算显示，C1337A、C1626T位点为中度多态(0.250.50)。关联分析结果表明，C1337A位点的CC基因型个体总产仔数显著高于CA基因型(P<0.05),AA基因型个体所产仔猪3周龄重、断奶重极显著高于CC、CA基因型(P<0.01);C1626T位点的CC基因型个体所产仔猪3周龄重、断奶重极显著或显著高于CT、TT基因型(P<0.01;P<0.05),CC基因型个体乳头数显著高于CT基因型个体(P<0.05)。【结论】FOXA2基因第3外显子存在3个多态性位点，与松辽黑猪总产仔数、3周龄重、断奶重和乳头数均有显著关联性。

• 单位
  吉林省农业科学院; 吉林农业大学