海南竹柏扁枝植原体基于16S rRNA和tuf基因的分类及系统进化分析

作者：杨毅; 赵文军; 车海彦; 曹学仁; 罗大全

来源：农业科技与信息, 2016, (35): 82-84.

DOI：10.15979/j.cnki.cn62-1057/s.2016.35.052

• 竹柏
• 扁枝病
• 植原体
• 分类
• tuf基因

对采自海南省万宁市的表现竹柏扁枝病的竹柏植株总DNA进行植原体16S r RNA基因和tuf基因克隆、测序,分别获得竹柏扁枝植原体16S r RNA基因(1 806 bp,Gen Bank登录号:KJ848639)和tuf基因(845 bp,Gen Bank登录号:KX645669)片段。对竹柏扁枝植原体16S r RNA基因序列进行虚拟RFLP分析,结果表明,竹柏扁枝植原体属于花生丛枝植原体组U亚组(16Sr II-U)成员(相似系数为1.00)。对tuf基因进行序列比对和系统进化分析,结果表明,竹柏扁枝植原体与同属16Sr II组的植原体亲缘关系最近,其次为16Sr I组植原体。本研究从亚组水平上确定了竹柏扁枝植原体的分类地位,并克隆分析了竹柏扁枝植原体的tuf基因,为竹柏扁枝植原体的系统分类和病害防控提供了基础信息。

• 单位
  中国检验检疫科学研究院; 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所