摄食不同种类饵料的鲤肝脏组织miRNA表达谱分析及验证

作者：罗杰; 杨淞; 杜杰; 刘巧; 杜宗君; 杨世勇; 李胜杰^*; 赵柳兰^*

来源：淡水渔业, 2020, 50(01): 31-37.

DOI：10.13721/j.cnki.dsyy.2020.01.005

• 鲤(Cyprinus carpio)
• miRNA测序
• 饵料
• 肝脏
• 差异表达miRNA

MicroRNA(miRNAs)是一类长度为18-25nt的内源性非编码单链小RNA,参与细胞增殖与凋亡、免疫、脂肪代谢等过程。本试验以三组投喂不同类型饵料的鲤(Cyprinus carpio)肝脏为研究材料,通过HiSeq 2500深度测序技术和生物信息学分析miRNA,鉴定出235个已知miRNAs。三种饵料组共表达的差异miRNAs有13个,随机挑选5个miRNA并采用qPCR进行验证,表达趋势在qRT-PCR结果和RNA测序结果中高度相似;对13个共表达的差异表达miRNAs进行靶基因预测,共预测到靶基因530个。对预测靶基因进行KEGG通路分析,结果显示参与2-羰基羧酸代谢,糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚定生物合成,柠檬酸循环(TCA循环)等通路的调节。本研究首次了解鲤摄食不同种类饵料的miRNAs表达特征,可以为深入了解miRNA对鲤摄食不同种类饵料过程的调控作用奠定基础。

• 单位
  动物科技学院; 四川农业大学; 中国水产科学研究院珠江水产研究所