基因型错误对定位QTL的LD指数效应

作者：李玉梅; 向阳; 孙振球

来源：国际遗传学杂志, 2009, 32(4): 241-248,257.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1673-4386.2009.04.001

• 连锁不平衡
• 基因型错误
• 数量性状位点
• 精细定位

目的 考察基因型错误对定位数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL)的连锁不平衡(LD)指数lx的影响.方法 从理论分析和计算机模拟的角度考察了基因型错误存在时LD指数lx的性质.结果 指数lx因依赖于基因型错误率而变小.结论 当基因型错误率达到0.03,lx值的改变量(减小值)将超过50%,特别是在标记基因频率比较高的时候.基因型错误的影响也通过基于血管紧张肽转化酶(ACE)基因的10个SNPs单体型频率的模拟研究得到了证实.

• 单位
  中南大学; 怀化学院; 公共卫生学院