鳄梨干旱与低温胁迫相关MYB转录因子的鉴定及表达分析

作者：王拓璋; 王毅^*; 陈娇娇; 张艺; 杨志娟; 郑元^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-25.

• 鳄梨
• MYB转录因子
• 转录组分析
• 干旱与低温胁迫

MYB是植物界中广泛存在的转录因子家族之一，其广泛参与植物生理生化、生物胁迫及非生物胁迫调控等过程。本研究利用本地BLAST比对获得鳄梨全基因组的MYB转录因子基因序列，分析PaMYB转录因子蛋白理化性质，保守基序预测，构建蛋白系统进化树，从而推断PaMYB的基因功能，对PaMYB进行分类，并通过转录组测序分析参与干旱与低温胁迫的MYB基因。从鳄梨全基因组中分析得到92个PaMYB基因序列，转录组表达分析显示有68个PaMYB在干旱胁迫下表达，72个PaMYB在低温胁迫下表达。将PaMYB家族蛋白和下载到的拟南芥MYB家族蛋白利用软件MEGA11构建进化树结果显示，其中PaMYB21、PaMYB26、PaMYB38、PaMYB46、PaMYB69、PaMYB70和PaMYB91与AT2G47460.1和AT1G56650.1聚为一支，推测其可能参与鳄梨在干旱胁迫下的调控；PaMYB11、PaMYB15、PaMYB25、PaMYB27、PaMYB40、PaMYB45与AT5G62470.2聚为一支，PaMYB36、PaMYB51、PaMYB52、PaMYB57、和PaMYB82与AT2G31180.1聚为一支，推测其可能参与鳄梨在低温胁迫下的调控。选取在干旱和低温胁迫时表达量较高的9个基因进行验证，RT-qPCR验证结果与转录组分析结果一致。本研究为深入研究PaMYB转录因子非生物胁迫提供科学理论依据。

• 单位
  西南林业大学