棉花芹菜糖/木糖合酶基因AXS2的克隆及表达分析

作者：李生梅; 庞博; 刘娜; 赵康; 刘思洁; 马尚洁; 于爽; 罗平; 高文伟^*; 王新燕^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-17.

• 陆地棉
• 海岛棉
• 基因克隆
• 芹菜糖/木糖合酶
• 表达分析

UDP-D-芹菜塘/木糖合酶基因对植物细胞壁中多糖化合物的稳定和转化至关重要。为了研究AXS2基因在棉纤维中的表达特征，本研究从陆地棉‘系9’和海岛棉‘新海16’中克隆了AXS2基因，并通过qRT-PCR检测AXS2在陆地棉和海岛棉纤维发育0 d、5 d、10 d、15 d、20 d的相对表达量。结果发现陆地棉‘系9’和海岛棉‘新海16’的AXS2基因在5～20 d表达量具有显著差异，且随着开花天数的增加，表达量上升，暗示该基因可能参与多个时期的纤维发育。利用生物信息学方法初步探讨陆地棉及海岛棉AXS2基因的差异，发现该基因在材料间存在核苷酸序列和氨基酸序列的差异，cDNA全长1161 bp，编码了386个氨基酸，属于NADB＿Rossmann超家族。多序列比对和系统进化树发现陆地棉与海岛棉的相似性为99.66%，两者与亚洲棉的亲缘关系最近。利用LOC TREE3预测AXS2蛋白亚细胞定位在细胞质。本试验为探究棉花AXS2基因在棉纤维发育中的生物学功能提供一定的参考。

• 单位
  新疆农业职业技术学院; 新疆农业大学