谷子NCED3基因克隆及生物信息学和表达模式分析

作者：王艳珂; 黎飞飞; 陈二影; 杨延兵; 管延安; 高文伟^*; 秦岭^*

来源：山东农业科学, 2022, 54(09): 1-7.

DOI：10.14083/j.issn.1001-4942.2022.09.001

• 谷子
• SiNCED3
• 基因克隆
• 生物信息学分析
• 表达分析

脱落酸(ABA)在植物生长发育中起着重要作用，9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)是ABA合成过程中的关键限速酶，关于谷子(Setaria italica)NCED基因研究的报道较少。本研究以济谷22为材料，通过RT-PCR克隆得到SiNCED3,生物信息学分析结果表明，其cDNA全长1 836 bp,编码611个氨基酸；SiNCED3蛋白相对分子质量为66.36 kD,等电点为6.15,为稳定蛋白，无信号肽，亚细胞定位预测定位于叶绿体中，含一个NCED基因家族典型结构域RPE65,二级结构主要由无规则卷曲和延伸链构成；启动子顺式作用元件分析表明其受光、ABA、生长素等调控。通过qRT-PCR发现，SiNCED3在谷子根、茎、叶、叶鞘、穗等组织中均有表达，根中的表达量最高；干旱、低温以及盐胁迫都可以不同程度地诱导SiNCED3在谷子幼苗中的表达，表明该基因可能参与调控谷子对不同逆境的响应。

• 单位
  山东省农业科学院作物研究所; 新疆农业大学