分析了各类院校环境工程专业特色,并比较了各校环境工程专业课程设置特点。结合当前农村农业环境保护需求,按照乡村振兴战略要求,提出了农业院校环境工程专业课程模块化设置思路。在专业教育中保有工程共性,理顺并构建农村农业环保相关知识体系,是农业院校环境工程本科教育引导培养涉农环境保护专业人才的关键。