一株临床多重耐药铜绿假单胞菌全基因组测序

作者:潘钰; 金剑峰; 田缘; 王学良; 于冲; 叶阳; 曲晓军; 田洁萍; 夏海华*
来源:生命的化学, 2022, 42(06): 1180-1187.
DOI:10.13488/j.smhx.20220214

摘要

为了解临床多重耐药铜绿假单胞菌的全基因组特征并探讨其多重耐药机制,利用Illumina PE测序平台对1株来自烧伤病人下肢分泌物中的多重耐药铜绿假单胞菌PA803进行全基因组测序,并通过生物信息学方法对分离菌株进行群体进化和分型分析以及基因功能注释。结果发现,PA803基因组大小为7 040 317 bp,GC含量为66.8%,预测编码6 528个基因,包含60个tRNA、2个rRNA。COG比对基因对应许多未知功能蛋白,KEGG分析发现与细菌耐药相关的生物膜形成、双组分系统和外排泵等代谢途径较为活跃,与数据库比对其序列分型为ST620,共有90个耐药基因和357个毒力因子基因,并构建系统进化树,显示其与美国2株铜绿假单胞菌菌株亲缘关系较近。临床多重耐药菌株给患者治愈造成很大困难,涉及多个基因及多种耐药机制,各机制之间的关系还需进一步研究。

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