花生叶全长cDNA文库的构建和部分表达序列标签分析

作者:陈华; 蔡铁城; 张冲; 邓烨; 熊发前; 唐荣华; 周双彪; 庄伟建
来源:福建农林大学学报(自然科学版), 2014, 43(06): 596-601.
DOI:10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2014.06.007

摘要

以‘闽花6号’品种为材料,利用SMART技术成功构建了花生叶不同生育时期混合的全长c DNA文库,并对文库的部分序列进行测序及分析.结果表明,该文库原始库容为2.25×106cfu·m L-1,重组率达100%,插入片段大小为750-2000bp,平均插入片段大小为1000 bp,达到文库质量要求.随机挑选50个单克隆进行5’端测序,共获得50条有效序列.通过与NCBI非冗余蛋白质数据库进行比对和注释,获得已知功能基因或具推测功能的基因25个,未知功能基因14个,新基因11个,其中49个(98%)基因为花生未报道的基因.参与代谢过程和胁迫响应的基因表达量较高.

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