呼吸道合胞病毒G蛋白抗原表位分析

作者：孙誉芳; 赵慧; 邹勇^*; 李长贵^*

来源：微生物学免疫学进展, 2022, 50(02): 34-40.

DOI：10.13309/j.cnki.pmi.2022.02.006

• 呼吸道合胞病毒
• G蛋白
• 表位预测

目的 利用生物信息学软件预测呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus, RSV)黏附蛋白G的B/T抗原表位。方法 BLAST在线分析RSV黏附蛋白G与人类蛋白同源性；TMHMM在线预测RSV G蛋白胞外区、跨膜区和胞内区结构；DNAstar软件分析该蛋白的二级结构、亲水性、柔韧性、表面可及性和抗原性，结合ABCpred和BepiPred预测B细胞表位；RANKPEP和SYFPEITHI超基序法远程预测Th细胞表位；NetCTL法、SYFPEITHI超基序法和IEDB在线预测CTL细胞表位。结果 RSV G蛋白与人类蛋白同源性较低；TMHMM在线预测RSV G蛋白胞外区位于64～298位氨基酸；DNAstar、ABCpred和BepiPred软件预测RSV G蛋白有5个B细胞表位，分别位于85～90、142～147、227～231、250～258、280～295位氨基酸序列；RANKPEP和SYFPEITHI预测该蛋白有10个Th细胞表位，主要位于第30～200位氨基酸之间，其中HLA-DRB1*0101表型相对的表位数目较多；NetCTL法、SYFPEITHI超基序法和IEDB预测该蛋白有9个细胞毒性T淋巴细胞表位，其中以HLA-A2限制性表位数目较多，分值较高。结论 RSV G蛋白含有较多潜在的B细胞和T细胞抗原表位，可作为RSV检测、治疗和预防的靶标。

• 单位
  长春生物制品研究所; 中国食品药品检定研究院