非直属培养基地研究生党建工作面临着"育人效果不佳,育人现状不能满足研究生教育培养潜在需求"的困境,其主要原因是党建工作协同育人体系尚未形成。因此,应从加强制度建设,促进专业技能学习与政治理论学习相结合,因院制宜、因地制宜,创建品牌党日活动等方面探索协同育人体系构建的有效路径。