甲状腺癌中m6A甲基化调控因子的表达及其预后价值

作者：王文龙; 沈聪; 孙博韬; 白宁; 李新营; 陈嘉欣; 彭婀敏^*

来源：中国普通外科杂志, 2021, 30(08): 934-941.

• 甲状腺肿瘤
• RNA甲基化调控因子
• 预后
• 计算生物学

背景与目的:甲状腺癌发病率逐年升高,但其发病机制仍不清楚,阐述甲状腺癌的发病机制对改善甲状腺癌患者的预后至关重要。研究表明,m6A甲基化调控因子高度参与癌症发生发展,具有良好的潜在预后价值。因此,本研究通过生物信息学方法分析甲状腺癌中m6A甲基化调控因子的表达并构建基于m6A甲基化调控因子的甲状腺癌预后模型。方法:从TCGA数据库下载甲状腺癌m6A甲基化调控因子的表达数据和相应的临床病理资料,通过Wilcoxon检验分析20个m6A甲基化调控因子在肿瘤和正常组织的差异表达;用一致性聚类分析将甲状腺癌患者分为两个聚类,比较两个聚类患者临床病理因素和总体生存率的差异;Lasso Cox回归分析构建风险预测模型并用ROC曲线下面积(AUC)评估模型的预测能力。结果:19个m6A甲基化调控因子在甲状腺癌和正常组织表达具有统计学差异(均P<0.05),其中HNRNPC、IGF2BP2、FMR1在甲状腺癌组织中明显高表达,而其余表达下调。聚类分析示,cluster 1生存期低于cluster 2 (P<0.05),颈淋巴结转移发生率明显高于cluster 2 (P<0.01)。基于Lasso Cox回归分析筛选的4个基因(IGF2BP2、RBM15、YTHDF1、YTHDF3)构建风险评估模型,相比低风险组患者,高风险患者生存期明显缩短(P=0.007);ROC曲线示,该模型可以预测甲状腺癌患者的预后(AUC=0.731)。结论:m6A甲基化调控因子在甲状腺癌中存在差异表达,基于甲状腺癌中关键m6A甲基化调控因子所构建的预后风险模型具有较好的预测能力,可为临床决策提供一定的依据。

• 单位
  中南大学湘雅医学院; 中南大学湘雅医院