新疆首次检测到猪圆环病毒3型及其全基因组进化分析

作者：任敏; 屈勇刚^*; 魏其; 宋敏; 谷思颖; 杨慧敏; 吴圆圆; 于会举

来源：黑龙江畜牧兽医, 2019, (21): 76-86.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2019.01.0189

• 猪圆环病毒3型
• 分离鉴定
• 全基因组测序
• 遗传进化分析

为了解新疆某规模化猪场猪圆环病毒3型(Porcine circovirus type 3,PCV-3)的流行现状、分子生物学特征和遗传演化规律,试验应用巢式PCR技术对新疆某规模化猪场的45份血液样本进行PCV-3基因检测和测序;利用TempliPhi 100 amplification Kit对检测到的PCV-3阳性样本进行全基因组扩增,将扩增得到的基因组片段克隆到Trans-T1载体中,经测序、拼接获得PCV-3基因组全长序列;利用MEGA 6. 0. 6和MegAlign软件对其全基因组进行遗传进化分析和同源性比较。结果表明:在新疆地区首次检测到PCV-3,且该猪场PCV-3的阳性率为20%(9/45),并获得PCV-3全基因组序列,长度为2 000 bp,命名为PCV-3/CN/Xinjiang-11/2018;与美国株PCV-3-US-SD 2016处于同一进化分支,属于3b亚群;与国内PCV-3/Pig/CN/Hebei20170320的同源性最高(99. 4%),与PCV-3-CN/Fujian-820-2016和PCV-3-CN/Fujian-318-2017的同源性最低(97. 8%),与国外美国株PCV-3-US-SD 2016的同源性最高(99. 1%)。说明新疆地区猪场已经存在PCV-3,应该引起养猪业的重视。

• 单位
  动物科技学院; 石河子大学