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摘要
本文为了解鳅科（Cobitidae）鱼类线粒体全基因组序列的结构特征和系统发育信息，利用生物信息学方法对已知的40种鳅科鱼类线粒体全基因组进行比对分析，用邻接法（NJ）了系统发育树。结果显示：（1）鳅科鱼类线粒体基因组全序列长度在16 553～16 937 bp之间，基因组的结构特征及基因排列顺序与其他硬骨鱼类一致。（2）鳅科鱼类线粒体全基因组一致序列长度为17 483 bp，变异位点数为8 039（45.9%），Kimura双参数平均遗传距离为0.19。在13个蛋白质编码基因中，ND2的变异程度（58.9%）和平均遗传距离（0.28）最大，变异程度最小的是12S rRNA（30.5%），tRNA拼接序列的平均遗传距离最小（0.07）。（3）Cox1、ND5、Cytb基因是进行鳅科鱼类系统发育分析较为理想的分子标记，NJ系统发育树显示，条鳅亚科（Noemacheilinae）是最早分化出来的一枝群系，位于祖先位置，沙鳅亚科（Botiinae）和花鳅亚科（Cobitinae）亲缘关系更近，互为姐妹群系。目前，有关鳅科鱼类线粒体全基因组的研究相对较少，本研究为鳅科鱼类进化学研究和分子标记的选取提供参考依据。
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