用于膀胱癌预后预测的lncRNA分子标记物开发（英文）

作者：李文省; 张彦丽^*

来源：Chinese Medical Sciences Journal, 2020, 35(03): 239-292.

• 膀胱癌
• 长链非编码RNA
• 预后
• 生存期
• 预测

目的探讨与膀胱癌预后相关的长链非编码RNA (lncRNA)分子标志物,建立膀胱癌患者的预后预测模型。方法从TCGA数据库中下载膀胱癌患者lncRNA的表达数据。使用单变量Cox回归和基于似然的生存分析发现预后相关的lncRNA分子标记。通过共表达分析和代谢通路富集分析对预后相关的lncRNA进行功能研究。采用多变量Cox回归分析建立风险评分模型,ROC分析确定模型的最佳分界点。通过Kaplan-Meier估计法和logrank检验对风险评分模型进行验证。结果我们发现7个预后相关的lncRNA标记(OCIAD1-AS1, RP11-111J6.2, AC079354.3, RP11-553A21.3, RP11-598F7.3, CYP4F35P, RP11-113K21.4)可以预测膀胱癌患者的生存期。通过对这些lncRNA的特点、其靶基因的共表达和代谢通路分析进一步揭示了lncRNA在膀胱癌的发生和发展中发挥重要作用。此外,我们建立并验证了基于7个lncRNA分子标记的的膀胱癌患者预后预测风险评分模型。值得注意的是,我们首次发现了两种与肿瘤相关的反义lncRNA (OCIAD1-AS1和RP11-553A21.3)在膀胱癌预后中的潜在意义。结论这些lncRNA分子标记可作为治疗膀胱癌的潜在靶点,值得进一步进行功能验证研究。

• 单位
  华中农业大学; 菏泽医学专科学校; 清华大学; 生命科学学院