牡丹SHMT基因的鉴定与生物信息学分析

作者：周广灿; 刘夏婷; 王博; 杜晶晶

来源：菏泽学院学报, 2023, 45(05): 106-114.

DOI：10.16393/j.cnki.37-1436/z.2023.05.009

• 牡丹
• SHMT基因
• 鉴定
• 演化特征

丝氨酸羟甲基转移酶(Serine hydroxymethyltransferase, SHMT)是一种磷酸吡哆醛(PLP)依赖酶，SHMT基因在为植物提供一碳单位和抗病虫害等方面发挥着重要作用.研究利用生物信息学方法从牡丹基因组数据库中鉴定得到33条SHMT基因.这些基因所编码的蛋白质含有69～603个不等数量的氨基酸，分子量大小为7.52～66.90 kD,理论等电点处于4.90～10.45之间，近2/3的基因都分布在第4条染色体上.启动子顺式作用原件分析显示，牡丹SHMT启动子中含有大量与植物光反应、应激反应等有关联的顺式作用原件.该研究结果可为牡丹SHMT基因功能的进一步研究奠定基础.

• 单位
  生物工程学院; 菏泽学院