基于TCGA数据库的肾透明细胞癌miRNA预后模型的构建及蛋白互作网络分析

作者：马牧溪; 张发财; 王明生; 马洪贵; 钟渠梁; 胡欢; 吴志平^*

来源：南京医科大学学报(自然科学版), 2022, 42(10): 1376-1386.

• miRNA
• 肾透明细胞癌预后
• 生物标志物
• 蛋白互作网络

目的：通过微小RNA(microRNA,miRNA)预后模型筛选肾癌高危人群并进行早期干预治疗，以提高患者的生存率。方法：基于癌症基因图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库，通过风险生存曲线、受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线及生存状态图对模型进行评价并对风险评分进行独立预后分析，筛选肾透明细胞癌预后相关的miRNA，建立预后风险模型。结果：(1)从TCGA数据库初步筛选3 613个差异性表达的m RNA和49个差异表达的miRNA。(2)通过单、多因素Cox回归分析筛选出3个与预后相关的miRNA构建风险预后模型，并且Train组、Test组和所有样品的高低风险组存在明显生存差异；3组样本1、3、5年生存分析的ROC曲线下面积均接近或大于0.70，风险评分可以作为独立预后因子。(3)在GO富集分析中，主要富集在肾单位的发育、突触后密度及离子跨膜转运蛋白活性等；而在KEGG富集分析中，主要参与其他类型的O-聚糖生物合成、N-聚糖生物合成等通路。结论：基于TCGA数据库构建的3个miRNA风险预后模型可作为肾透明细胞癌的预后生物学标志物。

• 单位
  贵州医科大学; 黔南布依族苗族自治州人民医院