铜绿假单胞菌PA902耐药分子机制的基因组水平分析

作者：陈定强; 向波; 杨羚

来源：实用医学杂志, 2017, 33(03): 462-465.

DOI：10.3969/j.issn.1006-5725.2017.03.035

• 铜绿假单胞菌
• 耐药性
• 高通量测序
• 分子机制

目的:应用高通量基因组测序技术研究铜绿假单胞菌PA902的耐药分子机制。方法:用Illumina Miseq平台对PA902进行高通量测序,用生物信息学技术对数据进行拼接和分析。结果:PA902对除阿米卡星以外的多种临床常用抗生素高度耐药,对测序数据进行分析发现,发现编码β-内酰胺耐药基因3个(blaOXA-10、blaPER-1和blaVIM-2),氨基糖苷类耐药基因4个(aph(3‘)-Ⅱd、aac(6’)-Ⅰb-cr、aacA4和aadA2),磺胺类耐药基因1个(sul1);四环素耐药基因1个(tet G);氯霉素耐药基因1个(floR),另发现多个染色体上可能与耐药相关的基因,基因分析结果与临床药敏结果完全吻合。对contigs进行分析,发现多个耐药基因常可定位在同一个contig上,并与可移动元件相关联。MLST分析发现PA902属于ST389,在国内属首次发现。结论:运用高通量测序技术阐明了PA902的耐药分子机制,其发现与临床药敏结果相吻合,可为传统微生物检验技术提供有力的支持。

• 单位
  广州医科大学附属第一医院