陆地棉COI家族基因鉴定及在干旱和盐胁迫下的表达分析

作者:李美丽; 宿俊吉; 杨永林; 秦江鸿; 李鲜鲜; 杨德龙*; 马麒*; 王彩香*
来源:中国农业科技导报, 2022, 24(04): 63-74.
DOI:10.13304/j.nykjdb.2021.0926

摘要

COI1(COR-insensitive 1)与Skp1-Cullin-F-box蛋白组成茉莉素信号转导的核心组分SCFCOI1复合物,在植物生长发育和响应逆境胁迫中发挥重要作用。从全基因组水平上鉴定出48个陆地棉COI家族基因,其不均匀地分布在21条染色体上,主要定位于细胞核和细胞质中。根据系统发育关系将其分为3个亚族(Ⅰ~Ⅲ),共线性分析发现COI基因以片段复制方式在陆地棉中进行扩张。陆地棉COI基因含有1~9个外显子,其启动子区域共存在6种逆境胁迫响应元件。转录组数据显示,分别有66.7%、56.25%、68.8%和27.1%的基因在NaCl、PEG、热和冷胁迫下表达量升高,且部分基因同时响应多种非生物胁迫;qRT-PCR验证结果显示,GhCOI5-A06强烈响应NaCl和PEG胁迫,是潜在的候选基因,表明GhCOI参与非生物胁迫应答。上述结果为后续深入解析该家族基因的功能奠定基础。

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