胃癌RNA结合蛋白相关预后模型的建立和验证

作者：马平川; 程光华^*; 戴云海; 陶绍能; 储昭阳

来源：现代肿瘤医学, 2022, 30(04): 652-659.

• 胃癌
• RNA结合蛋白
• 总体生存率
• 预后模型
• 生物信息学

目的:探讨RNA结合蛋白构建的胃癌预后模型并验证其准确性。方法:从癌症基因组图谱(Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库中下载胃癌的RNA测序数据,并测定正常组织和肿瘤组织中不同表达的RNA结合蛋白(RNA binding protein, RBPs)。并系统地研究及分析这些RBPs的表达和预后价值。结果:共鉴定296个不同表达的RBPs,其中166个表达上调,130个表达下调。7个RBPs(RNASE1、SETD7、BOLL、ADARB1、PPARGC1B、LARP6、MSI2)被鉴定为与预后相关的hub基因。基于以上基因构建的预后模型显示,高风险亚组患者总体生存期(OS)较低风险亚组患者低(P<0.05)。在train组中,预后模型的ROC曲线下的面积为0.730,test组中为0.653。列线图和HPA数据库进一步验证了胃癌和正常组织中7个关键RBPs的表达差异。结论:胃癌的RNA结合蛋白相关预后模型显示了良好的预后鉴别能力,它将有助于揭示胃癌的发病机制并提供新的临床诊疗思路。

• 单位
  皖南医学院弋矶山医院