下肢动脉硬化闭塞症膝下病变潜在机制的加权基因共表达网络和免疫浸润分析

作者：李见; 王玉涛; 王世信^*

来源：中国动脉硬化杂志, 2023, 31(08): 677-686.

DOI：10.20039/j.cnki.1007-3949.2023.08.005

• 下肢动脉硬化闭塞症
• 膝下病变
• 免疫浸润
• 加权基因共表达网络分析

[目的]探讨下肢动脉硬化闭塞症膝下病变的潜在机制和免疫相关性。[方法]从高通量基因表达数据库下载GSE100927数据集，利用R语言软件Limma数据包和加权基因共表达网络分析筛选与下肢动脉硬化闭塞症膝下病变相关的基因并进行信号通路富集分析；构建蛋白-蛋白相互作用网络并筛选下肢动脉硬化闭塞症膝下病变相关的核心基因，分析核心基因在下肢动脉硬化闭塞症膝下病变样本与对照样本间的差异，利用受试者工作特征曲线下面积评价核心基因的诊断效能。采用反卷积算法(CIBERSORT)评估各样本中免疫细胞分布并计算不同免疫细胞在下肢动脉硬化闭塞症膝下病变样本与对照样本间的差异。[结果]筛选获得下肢动脉硬化闭塞症膝下病变差异表达上调基因153个，差异表达下调基因63个，加权基因共表达网络分析结果表明下肢动脉硬化闭塞症膝下病变基因差异表达以上调为主，涉及胆固醇代谢、血小板活化等信号通路；蛋白酪氨酸磷酸酶受体C型(PTPRC)、Spi-1原癌基因(SPI1)、集落刺激因子1受体(CSF1R)和Fcγ受体Ⅲa(FCGR3A)可能是下肢动脉硬化闭塞症膝下病变的核心基因，且诊断效能较好。下肢动脉硬化闭塞症膝下病变与单核细胞的浸润程度呈正相关(r=0.419,P=0.037),与M2型巨噬细胞的浸润程度呈负相关(r=-0.491,P=0.013)。[结论]下肢动脉硬化闭塞症膝下病变涉及胆固醇代谢、血小板活化等多种信号通路；与单核细胞、巨噬细胞介导的免疫反应密切相关；PTPRC、SPI1、CSF1R和FCGR3A可能是下肢动脉硬化闭塞症膝下病变的核心基因。

• 单位
  徐州市中心医院; 济南市中医医院