山麻鸭OPN基因的克隆、表达及生物信息学分析

作者：潘晓丽; 林如龙; 王悦名; 严美姣; 连森阳; 李昂; 吴旭^*

来源：中国家禽, 2019, 41(09): 15-20.

DOI：10.16372/j.issn.1004-6364.2019.09.003

• 山麻鸭
• 骨桥蛋白基因
• 克隆
• 生物信息学
• 组织表达

应用RT-PCR、3′/5′RACE PCR扩增,克隆了全长为893 bp的山麻鸭Osteopontin(OPN)基因序列,GenBank登录号为XM013102822。运用生物信息学工具进行分析显示:OPN蛋白一级结构中丝氨酸、半胱氨酸、精氨酸、异亮氨酸、谷氨酸所占比例较高,预测分子式为C883H1383N253O267S12。二级结构预测有8.33%的α螺旋,35.56%的β折叠,56.11%的无规则卷曲。基于编码的氨基酸序列所构建的分子进化树表明,与绿头鸭的OPN基因属于同一分支,亲缘关系最近。在mRNA水平上,OPN基因在山麻鸭心、肝、脾、肺、肾、胸肌、胃、下丘脑、垂体、卵巢、漏斗部、膨大部、卵壳腺中均有不同程度的表达,其中在肾和卵壳腺中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01),在肝脏、卵巢、漏斗部和膨大部中的表达量也相对较高,在垂体、胃、脾和下丘脑中的表达量较低。

• 单位
  福建农林大学; 动物科学学院