传统基于表达式树ET的基因评估从性能角度讲主要缺点是:重复遍历表达式树和进行大量重复计算.提出基于Scale的基因评估.变量矩阵用来避免基因评估中的重复计算.实验表明,在绝大多数数据分布下和参数选择情况下:基于Scale的基因评估较基于ET的基因评估快3~5倍.