临床常见革兰氏阳性球菌蛋白指纹库的构建

作者：闫慧; 黄文芳; 杨永长; 肖代雯; 姜伟; 罗春丽

来源：中国生物工程杂志, 2011, (10): 95-99.

DOI：10.13523/j.cb.20111017

• 革兰氏阳性球菌
• 表面增强激光解析电离飞行时间质谱
• 蛋白指纹库 Gram positive cocci SELDI-TOF MS Protein fingerprint database

为建立临床常见革兰氏阳性球菌的蛋白指纹库,为快速鉴定这些细菌奠定基础,收集了从临床中分离获得的185株革兰氏阳性球菌,包括金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、溶血性葡萄球菌、粪肠球菌和屎肠球菌。将这些菌株分成建模组和验证组,利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱检测细菌蛋白,用ProteinChip和Biomarker Wizard软件对建模组细菌数据进行分析,筛选出每种细菌各自稳定表达的蛋白峰,并将数据导入自建的Fingerwave软件建立了临床常见革兰氏阳性球菌的蛋白指纹库。随后,将验证组细菌的蛋白峰数据与蛋白指纹库中蛋白峰数据进行相似度分析,以评价其鉴定符合率。建立了包含5种临床常见革兰氏阳性球...

• 单位
  四川省人民医院; 四川省医学科学院; 重庆医科大学