细粒棘球绦虫丙酮酸激酶生物信息学及系统发育分析

作者：周婧; 颜明智; 吕国栋; 马桂芝^*

来源：中国病原生物学杂志, 2022, 17(08): 912-923.

DOI：10.13350/j.cjpb.220809

• 细粒棘球绦虫
• 丙酮酸激酶
• 生物信息学

目的 运用生物信息学方法分析细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus sensu lato,Eg)丙酮酸激酶(Pyruvate kinase, PK)基因序列的结构与功能。方法 通过NCBI蛋白数据库获取EgPK基因序列，利用ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM、Motif Scan、ProtComp 9.0、CDD数据库、SOPMA、DNAStar、Swiss-Model Verify 3D、DNAMAN、VMD和MEGA等工具预测分析EgPK基因的相关生物学信息，并构建系统进化树，进行系统发育分析。结果 生物信息学预测EgPK具有亲水性，分子质量62.056 22 ku,无信号肽裂解位点，无跨膜区域。该蛋白含有3个N-糖基化位点，6个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点，6个N-肉豆蔻酰化位点，9个蛋白激酶C磷酸化位点。3D结构分析与序列比对显示，EgPK的桶状结构域和盖结构域之间存在特征性催化位点以及丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸磷酸化位点。EgPK基因序列与多房棘球绦虫PK基因相似性为94.67%,与人的PK基因相似性为54.77%,EgPK与多房棘球绦虫PK蛋白亲缘关系较近，与人、小鼠、家兔等哺乳动物亲缘关系较远。结论 EgPK具有PK的特征性结构域，可能参与细粒棘球蚴能量代谢相关活动。RNDFKEDT为EgPK的特征性活性位点，可作为开发抗囊型棘球蚴病的药物的候选靶点。

• 单位
  新疆医科大学; 新疆医科大学第一附属医院