猕猴桃几丁质酶基因克隆及生物信息学分析

作者：贺哲; 王园秀; 张圣洁; 蒋军喜^*

来源：江西农业大学学报, 2018, 40(06): 1241-1247.

DOI：10.13836/j.jjau.2018156

• 猕猴桃
• 几丁质酶基因
• 蛋白结构
• 生物信息学分析

为研究几丁质酶在猕猴桃抗果实熟腐病中的功能及抗性利用,对猕猴桃几丁质酶基因进行克隆并分析其蛋白结构。以猕猴桃抗病品种‘金艳’果实为材料,接种果腐病菌(Botryosphaeria dothidea),72 h后提取果实总RNA。使用引物对Ac C-F/Ac C-R和RT-PCR技术,扩增几丁质酶基因。克隆、测序和序列分析表明,该基因(命名为Ac CHI1,基因登录号MH580296)开放阅读框为795 bp,编码264个氨基酸,与茶树(Camellia sinensis)几丁质酶蛋白序列同源性最高,为81%。生物信息学分析表明,该蛋白属于I类几丁质酶,分子质量28.6 ku,等电点8.58,为亲水性稳定蛋白,含有信号肽,无跨膜结构,二级结构主要由无规则卷曲构成,三级结构与I类几丁质酶同源模板(4tx7.1.A)结构相似性为69.7%。研究结果为进一步开展猕猴桃几丁质酶基因功能研究和应用提供了理论依据。

• 单位
  江西农业大学