为明确保存香菇种质资源之间的亲缘关系,为选育具有自主知识产权、适应内蒙古西部地区栽培的新品种提供依据。采用ISSR分子标记,用10条引物对26个香菇菌株进行多态性检测,用NTSYS软件进行聚类分析和遗传多样性比较。结果表明,10对引物能够扩增出70条稳定的条带,多态性条带67条,多态性比率为95.71%,遗传距离变幅介于0~0.749 9之间。在遗传相似性系数为0.678时,菌株划分为4个类群。ISSR分子标记技术可有效揭示26个香菇菌株种质资源的遗传多样性和品种间的亲缘关系。