米槁叶绿体基因组结构及系统发育关系分析

作者：黎前利; 吴媛; 吴之坤^*

来源：种子, 2023, 42(11): 1-8.

DOI：10.16590/j.cnki.1001-4705.2023.11.001

• 米槁
• 樟科
• 叶绿体基因组
• 系统发育分析

本研究利用Illumina全基因组测序数据组装了米槁叶绿体全基因组：基因组总大小为152 751 bp,总GC含量为39.1%,包含一个93 662 bp的大单拷贝区(LSC)、一个18 861 bp的小单拷贝区(SSC)和一对20 114 bp的反向重复区(IRs)。整个叶绿体基因组共注释了125个基因[81个编码基因(CDS)、8个rRNA基因和36个tRNA基因],包括14个多拷贝基因和96个单拷贝基因。系统进化分析表明，用以构建系统发育树的樟属植物并不聚类为一个单系支系；从不同地区采集的两个米槁样品形成了一个单系支系，支持率为100%,与其他樟属植物有明显差异。完整的米槁叶绿体基因组为米槁的系统发育、保护、分子鉴定和可持续利用提供了基础信息。

• 单位
  贵州中医药大学