基于单细胞测序分析人结直肠癌白细胞抗原D受体抗原高表达CD209和CD163低表达型巨噬细胞诱导免疫抑制的机制

作者：林航^*; 凌云志

来源：中华实验外科杂志, 2023, 40(03): 435-438.

DOI：10.3760/cma.j.cn421213-20220323-00202

• 结直肠癌
• 巨噬细胞
• C-C基序趋化因子配体3

目的基于生物信息学分析结直肠癌(CRC)中肿瘤相关巨噬细胞(TAM)促进趋化因子C-C基序趋化因子配体3(CCL3)的分泌引导免疫负调节的机制。方法获取人CRC和正常组织(CON)中的scRNA-seq(单细胞转录组测序)数据进行降维、聚类、细胞注释, 分析不同表型TAM、调节T细胞(Tregs)UMAP分布;分析CRC-TAM基因差异表达和富集通路情况。String分析免疫负调控基因的蛋白-蛋白互作(PPI)。分析免疫负调控相关基因之间pearson相关性, 基于celltalker和cellphoneDB工具评估TAM分泌CCL3与Tregs之间的相互作用。卡方检验和Wilcoxon检验用于组间差异显著性分析。结果 CRC-TAM中CCL3表达量显著高于CON组(2.566±1.877比0.000±0.000 log2TPM, P<0.01), 且是免疫负调节途径(P<0.01)的核心基因;与免疫负调控基因包括IRF1(2.550±1.882比0.605±0.802 log2TPM, t=13.221, r=0.82, P<0.05)、TNFAIP3(2.550±1.882比1.037±1.039 log2TPM, t=22.419, r=0.90, P<0.01)、IFI16(0.451±0.671比0.605±0.802 log2TPM, t=5.914, r=0.80, P<0.05)等的表达呈中强正相关。CCL3主要在Mf1(100%, CD14hiHLA-DRloCD209loCD163lo)和Mf2(93%, CD14hi/loHLA-DRhiCD209loCD163lo)表达。CCL3阳性Mf2(CCL3+Mf2)与Treg表面配体-受体对IL1B-IL1R2/ICAM1-IL2RA/FN1-CD79A/CD14-ITGB1/CD14-ITGA4(R>3, P<0.01)有强相互作用。结论 CRC中CD14hi/loHLA-DRhiCD209loCD163lo型TAM可能分泌CCL3募集Tregs, 诱导免疫负调控。

• 单位
  广州医科大学附属第二医院; 深圳市人民医院