基于GEO芯片联合网络药理学探讨当归饮子治疗慢性荨麻疹的cross-talk及miRNA-mRNA机制

作者：包成通; 魏歆然; 张依依; 钟峰; 匡泓俊; 牛子青; 刘小娟; 王璐; 李俊熙; 章薇^*

来源：云南中医药大学学报, 2020, 43(04): 79-86.

DOI：10.19288/j.cnki.issn.1000-2723.2020.04.013

• GEO
• 当归饮子
• 慢性荨麻疹
• 网络药理学
• cross-talk
• miRNA

目的采用GEO芯片联合网络药理学的研究方法,初步探讨当归饮子治疗慢性荨麻疹(CU)的crosstalk及miRNA-mRNA机制,为后续实验研究提供理论基础。方法采用R语言limma包对GSE57178芯片进行差异分析;采用TCMSP、TCMID、PubChem、String、DAVID、TargetScan数据库对当归饮子有效成分、潜在靶点、PPI、KEGG、cross-talk及miRNA-mRNA机制进行预测分析。结果 GSE57178差异分析得出257个差异基因,其中240个基因表达上调(如:HIF1A、MMP12、STAT3等);有17个基因表达下调(如:FABP7、KRT15、LGR5等),其中有36个当归饮子治疗慢性荨麻疹的潜在靶点,拓扑分析出24个关键靶点基因在其中发挥重要作用;cross-talk分析得出1个靶点(SELE)在TNF通路与细胞粘附分子(CAMs) 2条通路中"串话";1个靶点(ITGB2)在吞噬体与CAMs 2条通路中"串话";2个靶点(CTSL、CTSS)在抗原处理表达、吞噬体与溶酶体3条通路中"串话";2个靶点(VCAM1、ICAM1)在NF-kappa B、TNF与CAMs 3条通路中"串话";1个靶点(TLR4)在HIF-1、NF-kappa B、吞噬体3条通路中"串话";miRNA-mRNA预测分析得出24个潜在靶点mRNA,构成了477组miRNA-mRNA模式,在CU炎症反应中发挥作用。结论本研究从基因、分子角度预测和分析了当归饮子治疗CU的多靶点、多cross-talk、多miRNA-mRNA作用机制,为后续研究提供了依据,可成为未来机制研究的新方向。

• 单位
  贵州中医药大学; 湖南中医药大学; 湖南中医药大学第一附属医院