棘孢木霉菌携带真菌病毒TaUV1的分离与鉴定

作者：张婷婷; 蔡小姚; 滕丽; 周静; 刘红美^*

来源：农技服务, 2020, 37(09): 11-17.

• 棘孢木霉菌
• 真菌病毒
• TaUV1
• 全基因组

为棘孢木霉菌株(Trichoderma asperellum)中病毒的鉴定提供参考,在棘孢木霉菌株中分离到真菌病毒Trichoderma asperellum Unassigned Virus 1 (TaUV1);对其全长基因组序列进行了分析,明确真菌病毒TaUV1的病毒分类学地位。采用随机引物扩增法获得TaUV1的全长基因组序列,使用DNAMAN、BlastP和MEGA等软件对TaUV1的全长序列进行拼接、比对和系统进化树分析。结果表明:真菌病毒TaUV1携带1条病毒条带,其基因组长度为9 838bp,GC含量为47.8。经序列分析显示,具有2个不连续的开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),即ORF1和ORF2。ORF1长4 509bp,编码假定蛋白(Hypothetical protein,HP);ORF2长3 984bp,编码RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRp)。ORF1和ORF2之间间隔113个碱基,在ORF1终止密码子TAA的5 684～5 686bp发现了1个移码序列七聚体(AAAAAAT),在此处发生了程序性-1的核糖体移码机制,使2个ORFS被通读,编码1个融合蛋白。基于TaUV1的RdRp序列进行的系统发育分析得知,TaUV1属于Unassigned Virus科的新成员。

• 单位
  贵州医科大学; 基础医学院