唾液腺腺样囊性癌中相关微小RNAs及其靶基因的生物信息学分析

作者：刘发煇; 侯婉云; 梁家东; 徐晶晶; 罗春英^*

来源：解剖学报, 2021, 52(04): 601-608.

DOI：10.16098/j.issn.0529-1356.2021.04.015

• 唾液腺腺样囊性癌
• 微小RNA
• 生物信息学

目的探讨唾液腺腺样囊性癌(SACC)潜在的微小RNAs(miRNAs)分子标志物,构建miRNA-mRNA调控网络,并阐明其潜在的分子机制。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载2个SACC的微阵列芯片数据,通过R语言进行分析差异的miRNAs与mRNA。应用Fun Rich 3.1.3软件对差异miRNA进行转录因子富集分析以及预测差异miRNAs的靶基因。对SACC中差异miRNAs的靶基因进行基因本体论(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析以及蛋白互作分析。使用Cytoscape 3.7.0构建miRNA-mRNA调控网络。结果 1.共筛选出144个差异表达的miRNAs (DEMs)和1216个差异表达的m RNAs(DEGs); 2.KEGG信号通路富集分析发现,靶基因主要参与Rap1信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路以及肌动蛋白细胞骨架的调节; 3.STRING蛋白相互作用分析发现,ACSL1、SCD、MGLL、FABP4在蛋白相互作用网络中处于核心地位。结论我们筛选出SACC与相对正常组织间差异明显的miRNA和m RNA,并分析发现了这些差异分子主要参与的信号通路和功能。

• 单位
  右江民族医学院附属医院