高危神经母细胞瘤差异表达基因的生信分析

作者：郭文才; 李锐; 李龙祥; 吴勇^*

来源：中国临床神经外科杂志, 2021, 26(08): 612-615.

DOI：10.13798/j.issn.1009-153X.2021.08.012

• 神经母细胞瘤
• 生物信息学
• 生物标志物
• 差异表达基因

目的应用生信分析方法筛选高危神经母细胞瘤的差异表达基因(DEG)。方法从GEO数据库下载2个高危神经母细胞瘤数据集(GSE49710、GSE73517),筛选DEG,应用GO和KEGG进行富集分析,构建PPI网络筛选中枢基因。结果GSE49710包括34个上调DEG和284个下调DEG,GSE73517包括62个上调DEG和309个下调DEG。GO分析显示,生物过程主要集中在细胞粘附、GTP酶活性的正调节、转录的负调节、DNA模板化、凋亡过程的负调节、中枢神经系统发育,调节的细胞成分富集在膜的组成部分、细胞外区域、质膜的组成部分、细胞外空间,调节的分子功能富集于钙离子结合、受体结合。KEGG分析显示在可卡因成瘾、造血细胞谱系、NOD样受体信号通路、糖胺聚糖生物合成-硫酸乙酰肝素/肝素中显著富集。PPI网络确定5个中枢基因(ADRB2、MC4R、CD69、RBFOX1和IL7R)。结论 ADRB2、MC4R、CD69、RBFOX1和IL7R可能与高危神经母细胞瘤的发生、发展相关,也可为高危神经母细胞瘤提供潜在治疗靶点。

• 单位
  巴中市中心医院