基于培养组学的肠道菌群培养及鉴定方法研究

作者：刘莹; 谭寅凤; 张迎; 孙菲; 许潆月; 何抒阳; 周艳秋; 于苗

来源：北华大学学报(自然科学版), 2021, 22(06): 762-768.

• 肠道菌群
• 培养组学
• 质谱鉴定

目的探索一种适宜临床应用的肠道菌群培养及鉴定的简便、实用方法,为临床诊断肠道菌群失调、制定个性化微生态调节方案、指导抗菌药物应用提供参考.方法应用GAM培养49种厌氧菌标准菌株,应用哥伦比亚培养基培养20种需氧菌标准菌株,监测各菌种的生长趋势;通过检测粪便标本OD600值,确定接种细菌的数量和体积;分别检测不同时间接种生长的粪便标本菌落数和种类,并对健康人和应用抗菌药物患者的肠道菌群进行对比分析;采用MADLI-TOF MS对生长的菌落进行鉴定.结果厌氧菌培养36 h、需氧菌培养18 h后90%以上的菌种达到生长平台期;接种5μL菌种,OD600值为0.045时,厌氧培养生长的菌落数最佳;接种50μL菌种,OD600值为0.050时,需氧培养生长的菌落数最佳;留样后0、1、2 h培养的菌落数和种类均多于3 h培养的菌落数和种类,差异具有统计学意义(P<0.05);对照组总菌数、厌氧菌数/需氧菌数、G-菌/G+菌、杆菌/球菌、益生菌占比均高于抗菌药物组,真菌数低于抗菌药物组,差异具有统计学意义(P<0.001).结论此方法可培养鉴定出人体肠道中的优势菌,获得评估肠道菌群的相关量化指标,并且成本低,操作简便,可为诊治肠道菌群失调、指导抗菌药物应用提供参考.

• 单位
  吉林市人民医院