5株PCV2四川株全基因组的克隆与遗传进化分析

作者：杨泽晓; 马玉峰; 汪开毓; 王印; 赵希仑; 姚学萍; 任冉阳; 陈平; 胡凌

来源：西北农林科技大学学报(自然科学版), 2016, 44(04): 1-16.

DOI：10.13207/j.cnki.jnwafu.2016.04.001

• PCV2
• 基因克隆
• 遗传进化分析

【目的】了解目前四川省猪圆环病毒2型(PCV2)的分子流行病学特征和遗传变异情况,探讨PCV2感染的控制对策。【方法】根据GenBank中发表的PCV2基因组序列设计2对特异性引物,对2012-2014年临床送检的PCV2感染病例材料中的5株PCV2全基因组序列进行扩增测序,并利用DNAStar等生物信息分析软件对获得的PCV2基因组序列进行分子特性与遗传演变分析。【结果】5株PCV2四川株全基因组序列长度都为1 767bp,均具有滚环复制起点(ORC)典型结构。序列比对和进化分析显示,5株PCV2四川株的基因序列同源性很高,基因组核苷酸序列及ORF1、ORF2和ORF3基因序列同源性分别为98.4%99.9%,97.5%99.6%,99.4%100%和96.2%100%,ORF1、ORF2和ORF3基因推导氨基酸序列同源性分别为98.4%99%,99.6%和91.5%100%;与47条参比PCV2毒株核苷酸序列的同源性比较发现,5株PCV2与国内一些新出现的PCV2毒株亲缘关系较近,且均属于PCV2d基因型毒株。【结论】5株PCV2四川株之间尽管存在着不同程度的基因变异,但遗传进化相对较稳定。

• 单位
  四川农业大学; 金宇保灵生物药品有限公司