肿瘤干性基因CDCA8对肺腺癌患者预后影响

作者：徐雷棣; 车映刚; 常宁; 张勇; 周英; 邱丹; 张艰^*

来源：国际呼吸杂志, 2021, 41(23).

• 肺肿瘤
• 腺癌
• 生物信息学
• 免疫细胞浸润
• 预后

目的筛选在肺腺癌(LUAD)中起关键作用的肿瘤干细胞相关基因(SRGs), 并研究作用机制, 和对患者预后的影响。方法从GEO数据库和TCGA数据库下载肺腺癌数据集的基因表达谱。使用R软件分析差异表达基因(DGEs), 并和SRGs交叉分析, 确定影响肺腺癌发生和预后的关键SRGs。采用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建方法对关键SRGs分析, 利用GO和GSEA进行富集分析。使用TIMER数据库分析SRGs对肿瘤免疫浸润的影响。此外, 分析SRGs与生存预后的关系。结果在数据集GSE68465中得到740个差异基因, 在数据集GSE31210中得到364个差异基因, 在数据集GSE115002中得到859个差异基因, 在TCGA数据集中得到4 464个差异基因, 4个数据集与肿瘤干性基因集取交集得到干性基因CDCA8。采用GO和GSEA分析CDCA8主要参与有丝分裂过程, PPI分析得到核心基因, TIMER分析CDCA8与多种免疫细胞表达水平相关, 高表达CDCA8肺腺癌患者预后较差。结论 CDCA8作为SRGs参与肺腺癌发生发展过程, 与肺腺癌免疫浸润相关, 是肺腺癌患者生存与预后评价指标之一, 并可为免疫治疗发展提供新的思路。

• 单位
  中国人民解放军空军军医大学