乌菜BcVIL2基因克隆及春化响应表达分析

作者：桂尚枝; 刘雪晴; 王英; 唐小燕; 赵龙龙; 李广; 吴思文; 温宏伟; 汪承刚; 陈国户^*

来源：西南农业学报, 2023, 36(09): 1843-1851.

DOI：10.16213/j.cnki.scjas.2023.9.003

• 乌菜
• VIL2
• 春化
• 基因克隆
• 表达分析

【目的】从乌菜(Brassica campestris L.)中克隆VIN3-LIKE 2(VIL2)基因并进行生物信息学与表达分析，为进一步研究BcVIL2基因功能奠定基础。【方法】以‘徽乌19’为试验材料，利用同源克隆等技术获得BcVIL2基因，对其序列进行蛋白分子量(MW)、糖基化位点、二级结构等生物信息学分析；利用荧光定量PCR等技术分析其应答春化表达模式。【结果】BcVIL2基因ORF (Open reading fragment)全长为1296 bp,共编码431个氨基酸，属于亲水性蛋白，预测含有1个潜在的糖基化位点和59个潜在的磷酸化位点，蛋白分子量为47.91 kDa,理论等电点(pI)为8.27;其二级结构主要由α-螺旋与无规则卷曲组成；亚细胞定位预测其可能在细胞核中发挥作用；同源序列比对分析显示该基因与芸薹属植物VIL2基因同源性较高；亲缘进化树分析也显示该基因与白菜(B.rapa, syn.B.campestris)和芥菜(B.juncea)VIL2基因亲缘关系很近；荧光定量PCR结果表明，盛花期时BcVIL2基因在根中表达量最低，在荚中表达量最高，而叶中表达量显著低于茎和花中表达量；一月苗龄植株春化后BcVIL2基因的表达量显著低于未春化时的表达量。【结论】乌菜VIL2基因响应春化负表达，与春化反应相关基因BraA01g032910.3C、BraA05g026410.3C与BraA10g016160.3C密切相关，可能存在互作关系，本研究结果为深入分析BcVIL2基因的功能提供了良好基础。

• 单位
  安徽农业大学