基于TARGET数据库筛选儿童急性髓细胞白血病的关键基因和信号通路

作者：邓颖; 熊安秀; 刘景珍; 祁闪闪; 熊昊^*

来源：中国医科大学学报, 2023, 52(10): 910-916.

DOI：10.12007/j.issn.0258-4646.2023.10.008

• 儿童急性髓细胞白血病
• TARGET数据库
• 生物信息学
• 分子标志物

目的 应用生物信息学方法对TARGET数据库进行分析，筛选儿童急性髓细胞白血病（AML）相关差异基因及信号通路。方法 从TARGET数据库下载AML患儿的临床信息和基因表达信息。采用R软件筛选低/中高危患儿的差异基因、初诊/复发患儿的差异基因。应用DAVID对差异基因进行富集分析。采用STRING和Cytoscape软件筛选枢纽（hub）基因。采用Cox回归分析hub基因与总生存期的关系。结果 通过分析TARGET数据库AML患儿的基因表达数据集，获得96个与危险度分层和复发相关的差异基因，其中上调基因38个，下调基因58个。蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析鉴定出15个hub基因。上调的7个hub基因与危险度分层呈正相关（均P <0.05），下调的8个hub与危险度分层呈负相关（均P <0.05）。Cox回归分析结果显示，15个hub基因影响儿童AML患儿的总生存期，其中DNMT3B、DPP4、CENPE和H3C10是影响儿童AML患儿总生存期的独立危险因素。结论 PPI网络分析鉴定出的15个hub基因可能是儿童AML潜在的分子标志物，为深入研究儿童AML的发病机制和治疗靶点提供方向。

• 单位
  华中科技大学同济医学院; 宜昌市中心人民医院