基于生物信息学探究miR-17-5p促进三阴性乳腺癌增殖迁移的机制

作者:贺鑫; 陈芳芳; 龚鹏举; 宋文静; 杨燕; 钱晨; 何浩东; 张京伟*
来源:武汉大学学报(医学版), 2022, 43(05): 755-761.
DOI:10.14188/j.1671-8852.2021.0574

摘要

目的:探究miR-17-5p对三阴性乳腺癌(TNBC)增殖迁移的调控作用及对患者预后的影响。方法:下载TCGA数据库中乳腺癌microRNA表达谱数据和临床病理资料,通过差异分析及Kaplan Meier生存分析,筛选TNBC预后相关microRNA。实时荧光定量PCR检测不同类型乳腺癌细胞系中miR-17-5p的表达水平,CCK-8、划痕实验检测miR-17-5p对TNBC细胞增殖及迁移能力的影响。Starbase数据库预测miR-17-5p靶基因,Metascape及STRING数据库对靶基因进行功能及信号通路聚类分析,并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,进而筛选下游关键调控机制。结果:TNBC中共有98个microRNA特异性表达上调,其中miR-17-5p在TNBC中表达高于非TNBC和正常组织(P<0.001),且与不良预后相关。miR-17-5p在TNBC细胞系中表达特异性升高,过表达miR-17-5p后TNBC细胞增殖及迁移能力显著增强,而抑制miR-17-5p表达后细胞增殖及迁移能力减弱。生物信息学分析筛选出407个miR-17-5p下游潜在靶基因及肿瘤相关的分子机制,其中FBXL5在TNBC中的低表达与患者预后不良密切相关(P<0.05),且miR-17-5p与FBXL5的mRNA表达水平显著负相关。结论:miR-17-5p在TNBC中发挥着致癌基因的作用,可通过调控肿瘤相关通路促进TNBC的发生发展,从而影响患者的预后。

  • 单位
    武汉大学; 武汉大学中南医院; 基础医学院

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