低深度高通量基因测序检测染色体拷贝数变异在产前诊断中的应用价值

作者：朱文娟; 魏莉; 魏友华; 韩颖^*

来源：中国医师杂志, 2022, 24(07): 1037-1041,1046.

• 产前诊断
• G显带核型分析
• 高通量核苷酸序列分析
• DNA拷贝数变异

目的探讨低深度高通量基因测序检测染色体拷贝数变异(CNVs)在不同产前诊断风险指征的应用价值。方法回顾性分析2017年1月至2020年12月在枣庄市妇幼保健院进行羊膜腔穿刺取羊水细胞进行高通量基因拷贝数变异测序(CNV-seq)评估胎儿染色体拷贝数变异的1 597例孕妇的基因检测结果, 并与G显带核型分析比较。结果 1 597例孕妇羊水细胞CNV-seq检测成功率为100%, 发现染色体CNVs 301例, 异常率为18.85%。其中致病性明确CNVs 208例, 占比为69.10%;致病性未知CNVs 93例, 占比30.90%。208例致病性明确CNVs中染色体非整倍体数目异常166例, 占比79.81%;染色体缺失/重复结构异常42例, 占比20.19%。不同产前诊断指征染色体CNVs的检出情况不同, NIPT筛查风险组染色体CNVs发生率最高(53.09%, 163/307), 其他依次为超声结构异常组(22.38%, 32/143), 染色体异常携带组(12.50%, 5/40), 其他异常情况组(11.34%, 22/194), 血清学产前筛查高危组(9.04%, 74/819), 高龄组(5.32%, 5/94)。与G显带核型分析相比, CNV-seq对于G显带核型分析确诊的166例染色体非整倍体异常和13例非平衡性染色体结构异常检出率为100%, 还可发现更多的致病性明确染色体微缺失/微重复异常。结论 CNV-seq对染色体CNVs的检测成功率高、耗时短、能够有效避免核型分析失败及耗时久的问题;且CNV-seq还能额外发现致病性明确CNVs, 提高阳性检出率, 有效预防缺陷患儿出生。因此, 不同产前诊断指征的孕妇进行羊水染色体核型分析的同时均应同时进行CNV-seq检测, CNV-seq可以作为产前诊断一线辅助诊断技术在临床进行推广应用。

• 单位
  无锡市妇幼保健院; 枣庄市妇幼保健院